Da un periodo non precisato, due fazioni iniziano a scontrarsi per la supremazia di un territorio molto vasto, suddiviso in numerosi regni, generando la famosa guerra del continente.
Una fazione riesce ad ottenere l'appoggio dei discendenti dei dragoni, degli esseri con incredibili poteri e dimensioni che cambiano ben presto l'esito dello scontro. L'altra fazione cerca di difendersi creando una nuova creatura in grado di mettere in difficoltà gli avversari.
Data la forza dei discendenti dei dragoni, anche detti Asarakam, la fazione opposta cerca di studiare un modo per controllare le sue creature per evitare che eliminassero le proprie truppe, decidendo dunque di fondare un'Organizzazione in un'isola per continuare gli esperimenti. Dopo aver imprigionato due Asarakam vengono utilizzate le loro carni per creare una sostanza in grado di trasformare dei comuni umani in esseri soprannaturali, dotati di abilità fisiche nettamente superiori a quelle degli altri umani.
Nello stesso periodo della fondazione dell'Organizzazione, compaiono delle creature chiamati Yoma che uccidono e diffondono disperazione tra gli umani e grazie all'Organizzazione e ai suoi guerrieri vengono periodicamente eliminati sotto segnalazione.
Dopo il risveglio di tutti i suoi compagni, Easley decide di risvegliarsi diventando di conseguenza il primo Abissale della storia. In seguito decide di stabilirsi nelle terre del Nord di Alphonse.
Improvvisamente Riful si risvegliando diventa la seconda Abissale e la prima numero 1 donna a risvegliarsi. In seguito si stabilisce nelle dell'Ovest di Lautrec.
Roxanne diventa la numero 35 dell'Organizzazione e partecipa alla sua prima caccia al risvegliato con la numero 5 Elizabeth come leader. Nello stesso momento incontra Uranus con la quale decide di stringere amicizia.
Roxanne impara alla perfezione la tecnica di Uranus e rimane impassibile alla sua morte durante una missione di caccia al risvegliato.
Roxanne diventa la numero 24 dell'Organizzazione e incontra la numero 9 Neideen in una missione di caccia da lei guidata.
Neideen perde improvvisamente la vita contro una risvegliato di rango inferiore in una missione di caccia insieme a Roxanne, la quale rimase impassibile alla sua morte. Inoltre Roxanne imparò alla perfezione la tecnica di Neideen.
Roxanne incontra Cassandra ma quest'ultima decide di non farsi seguire dalla numero 5. Tuttavia Roxanne con l'utilizzo della sua tecnica personale riesce a trovare il modo di vedere Cassandra combattere seriamente in una caccia al risvegliato e dopo questo incontro diede alla numero 1 il suo "soprannome".
Raffaella dopo l'incidente perde il suo numero e viene mandata in esilio per diversi anni. Nel frattempo incontra e conosce per la prima volta Teresa, al tempo ancora una tirocinante.
Rosemary assume il numero 4 e in seguito Teresa diventa una guerriera con un numero tra il 5 e il 9.
Hysteria perde il controllo e dopo aver rifiutato la sua condanna, viene attaccata dalle proprie compagne nella Collina di Rockwell. Hysteria uccide numerose guerriere ma viene fermata dagli attacchi di Teresa e in seguito uccisa da Rosemary.
Rosemary si risveglia volontariamente e invia a Teresa la sua carta nera con l'intento di ucciderla. Teresa riesce ad uccidere Rosemary nello scontro e mente riguardo a ciò che avvenne durante l'esecuzione di Rosemary.
Teresa svolge numerose missioni e in una città vicina a Teo incontra Claire per la prima volta. In città uccide ben 7 Yoma e libera Claire da uno di essi. Tuttavia Claire inizia a seguire Teresa senza il suo consenso.
Nel bosco Claire e Teresa vengono aggredite dai banditi i quali non recano nessun danno alle due, anzi, uno dei banditi Rig perde la mano sinistra a causa di Teresa.
Teresa decide di lasciare Claire nella città di Rokuto e prima di farlo, oltre a comprare dei vestiti in un negozio uccide lo Yoma della città.
I banditi aggrediscono gli abitanti della città di Rokuto uccidendo gli uomini e rapendo le donne. Teresa ritorna in città e per salvare Claire uccide Rig e in seguito anche gli altri banditi, per vendicarsi dei maltrattamenti ricevuti da Claire. Tuttavia Orsay vede la scena e segnala Teresa all'Organizzazione per aver ucciso degli umani.
Teresa viene condannata a morte dall'Organizzazione e vengono chiamate cinque guerriere sconosciute per la sua esecuzione. Teresa non accetta la condanna e ferisce le guerriere e diserta ufficialmente per continuare a vivere soltanto con Claire.
Le quattro guerriere perdono il loro primo scontro e Teresa e Claire lasciano il villaggio.
Priscilla decide di affrontare nuovamente Teresa rilasciando una quantità eccessiva di Yoki che la porta inesorabilmente al risveglio. Con una mossa astuta riesce ad uccidere Teresa la quale aveva abbassato la guardia, e in seguito anche le sue compagne Irene, Sofia e Noel che pensarono di fermarla.
Data la perdita delle prime cinque guerriere in classifica, Rubel cerca Raffaella per invitarla a far parte nuovamente dell'Organizzazione come numero 5 in cambio di informazioni su sua sorella Luisella.
Claire diventa una tirocinante e al suo fianco ha solo Elena. Supera il suo ultimo test e diventa una guerriera a tutti gli effetti diverso tempo dopo la morte di Teresa e ottiene il numero 47. Anche Ofelia diventa una guerriera ma solo in seguito viene identificata come la numero 4. Alisia e Beth invece sono rispettivamente la numero 1 e la numero 2 dell'Organizzazione.
La prima missione di Claire ad essere illustrata è quella che l'ha portata al lago nel quale ucciso lo Yoma liberando il 50% dello Yoki.
Viene mandata a Doga ad uccidere uno yoma, in città incontra Raki e nella stessa giornata uccide lo Yoma rivelatosi il fratello di Raki, Zaki. Dopo la missione, Claire lascia la città e si dirige verso un'altra città.
Nel frattempo Raki viene cacciato dalla città dopo aver perso la sua famiglia.
Claire raggiunge una città sconosciuta nella quale uccide lo Yoma che aveva parassitato il corpo del sindaco, lasciando di stucco tutti i presenti che si erano recati al municipio per incontrare la guerriera.
Claire raggiunge la città di Stra per l'eliminazione di un probabile risvegliato, ignorando il consiglio di Rubel di aspettare le altre guerriere del suo gruppo. Tuttavia incontra solamente un gruppo di Yoma composto da soli cinque elementi che sono stati spazzati via dalle abilità di Claire in pochi istanti.
Claire incontra per la seconda volta Raki nel deserto e date le condizioni del ragazzo decide di lasciarlo nella locanda della città di Egon.
Mentre Raki si risveglia e si dirige verso il bosco di Egon per ringraziare Claire trova una fantomatica guerriera che viene immediatamente smascherata dal ragazzo la quale si rivela essere uno Yoma. Per eliminarlo, Claire rischia di perdere la vita gettando la spada in un precipizio nel quale si butta a sua volta portandosi dietro lo Yoma per poterlo eliminare una volta per tutte. In quell'occasione Claire decide di portarsi dietro nel suo viaggio Raki con il ruolo di cuoco.
Rubel assegna un altro incarico a Claire, più precisamente la carta nera di Elena che la porta sul Monte Shire. Una volta raggiunta la destinazione la numero 47 incontra la sua cara amica di tirocinio Elena, la quale era ormai ad un passo dal risveglio. Nonostante l'insistenza di Raki, Claire uccide la sua compagna che a sua volta la ringrazia per averla fatta morire da essere umano. Il corpo di Elena viene in seguito seppellito sul Monte Shire da Claire e Raki.
L'Organizzazione riceve l'insolita richiesta di aiuto proveniente dalla città sacra di Rabona nella quale non erano ammesse le creatura soprannaturali. Rubel ne approfitta e manda Raki e Claire sotto le mentite spoglie di fratello e sorella. Claire viene intralciata dalla legge marziale vigente a Rabona e dalle guardie in particolare da Galk e Sid, tuttavia riesce a scontrarsi con lo Yoma costandole però quasi la vita. Dopo diversi giorni riesce a riprendere conoscenza e riaffronta lo Yoma ancora una volta in presenza di Sid e Galk riuscendo ad ucciderlo.
Rubel dà a Claire l'incarico di partecipare ancora una volta ad una missione di caccia però nella città di Gonahl. Arrivata a Gonahl con Raki scopre di essere in squadra solamente con Ofelia, in seguito rivelatasi una spietata assassina. Claire decide di separarsi da Raki per evitare che venisse ucciso da Ofelia e dopo la morte della risvegliata da cacciare, Ofelia cerca di uccidere Claire con diversi tentativi causandole nel frattempo la perdita dell'arto destro. L'ultimo viene però interrotto da Irene dalla spada fulminea.
Irene porta in salvo Claire nella sua abitazione in una valle circondata dalle montagne, nella quale le insegna la Spada fulminea. Dopo diversi tentativi, tutti fallimentari, Irene dona alla Numero 47 il suo ultimo arto, quello destro, affinché Claire possa continuare a lottare e portare avanti il ricordo di Teresa.
Dopo la partenza di Claire, Irene viene raggiunta da Raffaella la quale inizialmente si presenta in veste di esecutrice e inspiegabilmente cambia idea.
Claire incontra nuovamente Ofelia, quest'ultima si è però risvegliata ed intenzionata a portare a termine il trattamento che voleva riservare alla Numero 47. Claire cerca di affrontarla e grazie alla Spada fulminea e all'incoraggiamento della stessa risvegliata, riesce ad ucciderla.
Claire continua a cercare informazioni su Raki ma solo quando raggiunge la statua delle Dee Gemelle e incontra una ragazzina di nome Nina, in compagnia di suo fratello, scopre qualcosa. Nina spiega la storia delle Dee Gemelle delle quali era molto interessato anche Raki.
Jean e Katia sono le uniche ancora in vita anche se torturate, mentre Raquel giace in un angolo della stanza trafitta dalle aste di Duff.
Katia, la numero 32, si risveglia ma non rispettando lo standard dei risvegliati che Riful desidera avere al suo fianco come alleati, quest'ultima ordina a Duff di ucciderla.
Galatea arriva prima che Duff possa uccidere Claire e grazie alla sua manipolazione riesce a trarre in salvo la Numero 47 e a dirigersi senza difficoltà verso l'uscita, fin quando questa non viene bloccata definitivamente da un attacco di Duff.
Galatea ingaggia un combattimento con Duff riuscendo ad ottenere ottimi risultati che avrebbero presto portato alla morte Duff.
Riful dell'Ovest compare e dà dei consigli utili a Duff per contrastare il potere di Galatea, la quale è costretta a schivare i suoi colpi.
Ad un certo punto dello scontro, Galatea manda Claire a cercare Jean per via della sua potentissima stoccata, tuttavia la numero 9 si trova già in un avanzato stato di risveglio.
Claire riesce a riportare Jean alla normalità e riceve in dono da quest'ultima la sua stessa vita e la sua collaborazione per uccidere Duff.
Galatea viene ritrovata ferita gravemente, ma dopo essersi tolta le aste di Duff dal corpo continua a combattere al fianco di Jean e Claire. Le tre attuano una strategia che inizialmente si rivela fallimentare, ma Claire e Jean da sole riesco a bloccare Duff (con la spada fulminea) e a trafiggerlo (con la spada perforante) riducendolo in fin di vita.
Riful salva Duff da morte certa risvegliando il suo braccio destro, in questo frangente viene trafitta da Claire e in seguito si trasforma nella sua forma da risvegliata. Dopo aver distrutto il castello, Riful rivela quello che aveva promesso alla Numero 47, cioè il nome dell'abissale del Nord, Easley e dell'esistenza di una risvegliata (Priscilla) che lui aveva ucciso.
All'interno dell'Organizzazione viene deciso di inviare 24 guerriere al Nord per poter eliminare i risvegliati.
Rubel, accompagnato da Raffaella, riesce a trovare Claire e Jean per dare loro l'incarico di far parte del gruppo di guerriere. Nella stessa occasione, Claire viene a sapere da Rubel che Raki si trova al Nord prigioniero di alcuni trafficanti di uomini.
Easley invia i primi tre risvegliati per fronteggiare le guerriere. Questi attaccano prima che le guerriere possano prepararsi e uccidono diversi abitanti.
Miria porta in salvo una ragazzina e prende il comando della situazione assegnando alla sua squadra il risvegliato in piazza e alle altre quattro squadre i due che si trovavano sui tetti.
Raki incontra Priscilla in una città completamente distrutta e viene invitato da Easley a viaggiare con loro.
La squadra di Miria anche se per ultima riesce ad eliminare da sola un risvegliato costando a Yuma il braccio sinistro.
Prima dell'ultima battaglia a Pieta, le guerriere tengono una riunione per parlare delle possibilità di sopravvivenza delle guerriere e della tattica escogitata da Miria per poter salvare il numero maggiore di guerriere.
Dopo essersi preparate per l'ultima battaglia, le guerriere attendono i risvegliati nelle loro postazioni ma ogni squadra inizia a perdere elementi. Le povere guerriere vengono brutalmente uccise davanti agli occhi increduli delle compagne di squadra.
Dopo la morte di alcune guerriere e risvegliati, Riccardo scende in campo e elimina tutte le capitane a partire da Veronica, poi con Undine, con Jean e infine con Flora.
Claire risveglia le proprie parti del corpo e dopo un lungo combattimento riesce ad uccidere Riccardo e il suo avanzato stato di risveglio viene bloccato da Jean, la quale perse la vita pur di riportarla indietro come fece per lei Claire stessa.
Nel frattempo molte guerriere perdono conoscenza o addirittura la vita e le uniche rimaste in piedi sono Miria, Claire, Deneve, Helen, Zelda e Cinzia.
In una città vicina invece Raki si trova con Priscilla e Easley, i quali contano le luci delle guerriere che si spengono piano piano.
I risvegliati continuano il loro viaggio e si dividono in due gruppi numerosi: uno diretto verso l'Organizzazione e l'altro verso Riful ad Ovest. Easley invece si dirige verso Sud per scontrarsi con Luisella. Raki e Priscilla lo seguono.
Riful e Duff uccidono quasi subito tutti i risvegliati che hanno deciso di scontrarsi con loro, mentre ai 18 risvegliati diretti verso l'Organizzazione trovano la morte a causa di Alisia e Beth, rispettivamente la numero 1 e numero 2 dell'Organizzazione.
Ad osservare e ad ammirare da vicino le due guerriere vi è Galatea, la quale interessata a conoscerle viene invitata da Rubel a non presentarsi.
Luisella viene sconfitta da Easley e incontra dopo diversi anni sua sorella Raffaella dalla quale viene prima uccisa e al tempo stesso salvata creando una sorta di fusione tra i loro corpi. Riful che si trova nei paraggi, prende con sé i corpi fusi di Luisella e Raffaella per farli risvegliare.
Le sette guerriere riescono a sopprimere il loro Yoki col passare degli anni e nel frattempo si allenano nelle diverse discipline e creando il gruppo dei Sette fantasmi.
L'Organizzazione cambia la sua politica di caccia ai risvegliati e inizia a cacciarli anche senza richiesta per evitare la formazione di gruppi consistenti come l'armata di Easley al Nord.
Clarice è la primissima guerriera a fare la sua apparizione ed è la nuova numero 47. Inoltre è l'unica guerriera colorata ad essere riuscita a sopravvivere alla trasformazione in mezzo demone.
Clarice è l'ultima ad arrivare a destinazione, però raggiunge il luogo della caccia insieme al suo gruppo.
Clarice è l'unica a non intervenire contro il risvegliato e al tempo stesso a perdere conoscenza senza essere toccata minimamente dagli alleati del nemico
Prima di poter decidere come uccidere definitivamente le guerriere, i tre risvegliati vengono uccisi dal gruppo dei sette fantasmi e le guerriere curate da Cinzia.
Clarice è la prima a riprendersi (dato che non è stata nemmeno colpita dai risvegliati) e trova il cimitero di Alphonse. Dopo la conta delle spade capisce che non tutto fosse come le era stato raccontato.
I sette fantasmi si trovano già al confine delle terre dell'Ovest, felici rivedere i colori dei paesaggi degli anni passati. Tabitha percepisce lo Yoki di ben 12 guerriere, compresi quelli di Audrey e Rachel.
Avvenimenti riguardanti il gruppo di Audrey ad Ovest.
Rachel e Audrey riescono a trafiggere l'abissale, ma la numero 3 rendendosi conto della vera forza di Riful si paralizza e Rachel viene trafitta dai tentacoli dell'abissale. nel frattempo le loro due compagne scappano.
Le quattro disertrici raggiungono le due guerriere sconosciute del gruppo per colpirle e far perdere loro conoscenza.
Helen e libera Audrey e Rachel le quali vengono a sua volta prese come le compagne in braccio, per essere portate in salvo da Riful dell'Ovest. Dopo una breve conversazione tra Riful e Claire, i Sette fantasmi scappano con le guerriere dell'ultima generazione, provocando le ire dell'abissale.
Le disertrici fanno assumere alle guerriere dell'ultima generazione la pillola per sopprimere lo Yoki e Audrey dopo aver ripreso conoscenza se ne accorge a causa del mal di testa. In quel momento vede i Sette fantasmi e da Miria e Claire le vengono poste diverse domande, alle quali risponde soltanto parzialmente. In quell'occasione afferma che Galatea sia morta ufficialmente in una caccia al risvegliato e che Raffaella sia rimasta coinvolta nella lotta tra i due abissali al sud.
Avvenimenti riguardanti il gruppo di Clarice e Miata.
Le due vengono mostrate mentre cacciano un risvegliato, in seguito ucciso da Miata.
Ritornano all'Organizzazione per ricevere nuovi ordini e tra questi vi è l'eliminazione di Galatea. Il ruolo di Clarice è quello di dare a Miata le pillole per sopprimere lo Yoki, ma lungo il cammino combattono svariate volte tra Yoma e risvegliati fino a raggiungere le mura di Rabona.
Clarice e Miata entrano a Rabona e raggiungono Galatea, che negli anni aveva assunto l'identità di Sorella Latea, la suora della chiesa di Rabona. Miata l'affronta incurante dei danni che recava alle strutture e per evitare di morire Galatea decide di difendersi. Lo scontro non dura molto perché a fare la sua apparizione è la stessa risvegliata.
Agata viene attaccata da diversi soldati molti dei quali vengono brutalmente uccisi.
Galatea cerca di ottenere l'appoggio di Miata e Clarice per uccidere Agata, invece tutto le si ritorce contro perché oltre ad Agata subisce gli attacchi di Miata intenta a portare a termine la missione dell'Organizzazione. A causa di questo combattimento perde il braccio sinistro.
Il combattimento a tre dura diverso tempo e reca dei danni sia a Galatea che a Miata, mentre Agata subisce un attacco alla struttura che la manteneva solamente da una ex guerriera.
Claire rivela la sua identità e insieme agli altri membri dei Sette fantasmi distruggono tutte le zampe rimanenti della struttura di Agata costringendola a scendere. Galatea viene liberata da Miria che si accorse della cecità di Galatea e della mancanza del braccio sinistro.
Agata inizia così a difendersi creandosi attorno al su corpo una corazza di capelli abbastanza grande da poter rimanere in costante movimento.
Grazie alle indicazione dell'ex numero 3 e di Tabitha, i Sette fantasmi riescono a vanificare il tentativo di Agata di sopravvivere grazie alla corazza, costringendola a restare a diretto contatto con le sue nemiche.
A Doga, scoperta la presenza di uno Yoma, Kakumo fugge dopo aver rubato molto denaro e una carrozza. Durante la fuga incontra Raki e Priscilla e li informa su ciò che avrebbero incontrato se avessero raggiunto la città.
Avvenimenti accaduti a Rabona dopo le rivelazioni di Miria.
Miria invita le sue compagne a portare a termine le loro questioni personali dando loro la possibilità di dividersi.
Helen e Deneve partono per le loro città di origine e si dirigono verso sud.
Claire è sempre intenzionata a trovare Raki ma la sua istintività non resta inosservata e Miria la fa accompagnare da Cinzia e Yuma che non hanno la possibilità di raggiungere le loro città natale.
Tabitha invece sceglie di restare al fianco di Miria
Duff e Riful immobilizzano e torturano la numero 6 Renee e quando riprende conoscenza si ritrova senza i suoi arti. Riful le rivela il motivo cui l'ha rapita e e le mostra le spoglie di Luisella e Raffaella.
Renee viene liberata per potersi riattaccare gli arti e nel frattempo riesce a sincronizzarsi con i corpi fusi delle due Distruttore. Pochi istanti dopo è costretta a lasciar perdere per via della potenza incredibile del loro Yoki e dopo gli avvertimenti di Riful, escogita un piano per poter scappare dal risveglio di quella creatura, dal quale sarebbe riuscita a sopravvivere solamente Riful.
Claire, Cinzia e Yuma raggiungono la città di Lacroix per eliminare una risvegliata. Tuttavia incontrano un gruppo di guerriere capeggiate dalla numero 14 Lina che vengono però stordite dalle disertrici affinché non venissero riconosciute. Dopo aver ucciso la risvegliata, le tre incontrano e conversano con Rubel, il quale rivela loro indirettamente di essere una spia.
Deneve e Helen raggiungono una città molto popolata nella quale risiedeva anche l'Abissale del Nord. Subito dopo l'ingresso in città le due incontrano l'abissale, il quale dopo aver conversato con loro circa la caduta accidentale di Helen le attacca con l'intenzione di ucciderle in un colpo solo.
Dietrich nel frattempo incontra il cosiddetto diavolo da lei menzionato poco tempo prima con le due disertrici, le quali lo hanno confuso per Easley.
Dopo essersi preparate a dovere, le disertrici compresa Galatea raggiungono con Raki il bozzolo contenente Claire e Priscilla, che vengono liberate contemporaneamente da Raki stesso.
Viene rivelato il segreto che le guerriere nascondono con le loro uniformi.
Priscilla e il Distruttore combattono per l'appropriamento del corpo, ma nel frattempo colpiscono diversi risvegliati e soltanto alcuni riescono a sopravvivere.
Due differenti risvegliate vengono catapultate a Rabona e vengono costrette a trasformarsi a causa delle ferite. Claire e Miria affrontano ed eliminano una risvegliata molto simile ad Agata, mentre Helen riesce ad uccidere grazie a Galatea la risvegliata rimanente con la Spada perforante.
Dopo l'arrivo dei Sette fantasmi e di Raki nelle vicinanze di Rabona, Miria riconosce in altre risvegliate una numero 3 e una numero 5 e tante ex cifre singole.
Europa sin da molto giovane diventa una guerriera e per via della sua pigrizia non arriva ai suoi vertici nonostante abbia le capacità di diventare una numero 1. Per via di questo comportamento ottiene il soprannome di Europa la pigra. Da risvegliata infatti è infatti paragonabile ad un abissale.
Nota per la sua forza e astuzia, Agata ottiene il rango di numero 2 e il soprannome di Agata dal sangue freddo. Per qualche strano motivo è stata riconosciuta da Galatea nonostante quest'ultima fosse cieca al momento dell'incontro.
La risvegliata apparsa a Gonahl uccide prima gli abitanti e viene in seguito cacciata da Claire e Ofelia. Tuttavia Rubel parla di lei come una ex guerriera abile perché cifra singola e di una risvegliata da non sottovalutare. Non è noto se abbia fatto parte dell'Organizzazione durante l'epoca di Alisia e Beth come numero 1 e numero 2.
Infanzia delle guerriere in epoche differenti[]
Teresa viene venduta dai propri familiari o dalla popolazione del suo villaggio direttamente all'Organizzazione.
Alisia e Beth vengono prelevate subito dopo la nascita dalle loro famiglie per far parte dell'Organizzazione. Lo stesso accade alle gemelle della famiglia Zema.
Priscilla diventa una guerriera dopo aver ucciso il proprio padre, ormai divenuto uno Yoma che peraltro aveva già ucciso tutti gli altri membri della famiglia.
A seguito della morte di tutti i membri della famiglia, Claire viene sequestrata da un gruppo di Yoma e successivamente salvata da Teresa, con la quale vive fino alla sua morte. In seguito decide far parte dell'Organizzazione spontaneamente.
Cinzia perde tutti i familiari a causa dell'attacco di un gruppo di risvegliati nella sua città natale.
Clarice perde tutti i membri della propria famiglia per motivi sconosciuti e in seguito viene ritrovata nella sua città natale ormai disabitata.
Dietrich perde tutte le persone care a causa di un gruppo di risvegliati e accetta di far parte dell'Organizzazione volontariamente, dato che crede che i membri le abbiano salvato la vita.